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Comparatif des logiciels pour auto-entrepreneurs — 15 solutions au crible, et l’étape au-dessus

Par Arthur Gueroult · Publié le 22 août 2026 · Données vérifiées aux sources · 0 lien d’affiliation

Comparatif des logiciels pour auto-entrepreneurs 2026 : tableau interactif des 15 solutions
v1.0Publié le 22 août 2026 — statuts plateforme agréée et offres relevés aux sources des éditeurs.
Historique des mises à jour

v1.0 (22/08/2026) : première publication — 15 solutions micro et indépendants, statuts plateforme agréée, sélecteur guidé, positionnement de l’étape au-dessus.

Plus de 2,4 millions de micro-entrepreneurs actifs en France, et un paradoxe : jamais l’offre de logiciels n’a été aussi riche — ni aussi difficile à départager, entre gratuits remarquables, facturiers purs et copilotes administratifs. Ce comparatif fait le tri, sans affiliation. Et il assume une conviction d’éditeur : les outils micro sont excellents dans leur périmètre — l’important est de reconnaître le jour où votre activité en sort.

En 30 secondes

  • Les gratuits français sont excellents : Abby, Indy et Tiime couvrent la facturation conforme sans frais — et ce sont des plateformes agréées immatriculées.
  • L’échéance a tout changé : depuis le 1er septembre 2026, tout auto-entrepreneur doit pouvoir recevoir des factures électroniques ; l’émission suivra en septembre 2027. La colonne « Plateforme agréée ? » est devenue le premier critère.
  • Freelance ≠ artisan : facturer du temps et chiffrer des ouvrages sont deux métiers — le tableau distingue les profils, outils bâtiment compris.
  • L’étape au-dessus existe : quand les devis techniques, la marge par affaire et les fournitures débordent de l’outil micro, c’est le terrain de WHY Efficience — notre cœur de cible est plus grand, mais les auto-entrepreneurs techniques y sont chez eux.

Septembre 2026 : l’échéance qui a changé la question

Choisir un logiciel d’auto-entrepreneur n’est plus une affaire de confort : depuis le 1er septembre 2026, la facturation électronique s’applique à tous — micro-entrepreneurs compris.

Concrètement : toute entreprise, quel que soit son régime, doit désormais pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée ; et au 1er septembre 2027, les micro-entreprises devront aussi émettre leurs factures au format structuré. Un PDF envoyé par mail ne sera plus une facture conforme entre professionnels. La conséquence pratique est dans le tableau ci-dessous : certains outils gratuits très répandus sont eux-mêmes immatriculés plateformes agréées — la conformité est incluse — quand d’autres devront s’adosser à une plateforme tierce. Pour la liste complète des opérateurs immatriculés, notre annuaire interactif des plateformes agréées fait référence.

Le tableau interactif : 15 solutions, et l’étape au-dessus

Recherchez, filtrez par profil, par gratuité ou par statut plateforme agréée. La dernière ligne assume notre position dans ce paysage.

Profil
Gratuit
Plateforme agréée

16 solutions affichées

Solution Pour qui Offre gratuite Plateforme agréée ? Ce qu’il fait bien La limite quand ça grandit
Abby Micro-entrepreneurs, tous métiers Oui — socle gratuit durable Oui — immatriculée en son nom Le tout-en-un du micro : facturation, livre des recettes, déclaration URSSAF connectée, alertes de seuils. Pensé pour le régime micro : à la sortie du régime ou sur les devis techniques longs, l’outil atteint sa frontière.
Indy Indépendants, BNC, professions libérales Oui — facturation + compte pro gratuits Oui — immatriculée en son nom Facturation gratuite illimitée, compte pro avec IBAN, comptabilité automatisée et déclarations au payant. Très orienté services et professions libérales : peu d’outillage devis-métré pour les activités techniques.
Tiime Indépendants, souvent avec un comptable Oui — facturation gratuite Oui — immatriculée en son nom Gratuit solide, gestion bancaire connectée, passerelle naturelle vers l’expert-comptable. La déclaration URSSAF et les fonctions avancées supposent le payant ou le cabinet ; pas d’outillage chantier.
Henrri TPE et micro, facturation pure Oui — gratuit sans plafond Non — s’adosse à une plateforme agréée tierce Devis et factures illimités gratuits (groupe Rivalis), encaissement par lien ou QR dès l’offre gratuite. Facturation pure : ni URSSAF, ni compta, pas d’application mobile — et la conformité passe par une plateforme tierce.
Facture.net Micro et TPE au budget zéro Oui — entièrement gratuit Non Gratuit avec un mini-CRM intégré ; suffisant pour émettre proprement ses premières factures. Le strict minimum : pour la réception des factures électroniques, il faudra une plateforme agréée à côté.
Freebe Freelances du digital Non — payant À vérifier sur l’annuaire officiel Pensé freelance : suivi du temps, gestion clients, anticipation des charges (CFE, cotisations). Payant dès le départ et centré prestation de services : hors sujet pour l’artisan qui chiffre des fournitures.
Qonto Facturation Indépendants et TPE, compte pro Oui — inclus, même sans compte Qonto Oui — immatriculée en son nom Émission et réception illimitées, rapprochement bancaire, suivi des impayés — adossé au compte pro. La facturation reste un satellite du compte bancaire : pas de devis techniques, pas de gestion d’affaires.
Shine Facture Indépendants, compte pro Oui — inclus dans le compte Oui — immatriculée en son nom Facturation conforme incluse dans le compte pro, y compris l’offre sans frais mensuels. Même logique que Qonto : très bien pour facturer simple, pas conçu pour chiffrer un chantier.
Zervant Micro-entrepreneurs, artisans débutants Freemium À vérifier sur l’annuaire officiel Interface simple née en Finlande, appréciée pour démarrer la facturation sans friction. Éditeur non français : conformité micro-BNC/BIC et raccordement à la réforme à vérifier de près.
Superindep Freelances tech et consultants Non — payant À vérifier sur l’annuaire officiel L’administratif du freelance automatisé : URSSAF, TVA, aide au passage en société. Un copilote administratif plus qu’un outil de production : rien pour le devisage technique.
MyAE Micro-entrepreneurs historiques Freemium À vérifier sur l’annuaire officiel L’un des pionniers du genre : facturier et registres du micro, tarifs modestes. Interface datée et périmètre strictement micro : l’outil ne suivra pas une activité qui se structure.
Solo (Portail AE) Micro-entrepreneurs accompagnés Freemium À vérifier sur l’annuaire officiel Adossé à l’accompagnement du Portail auto-entrepreneur : facturation plus conseil. La valeur est dans l’accompagnement ; l’outil lui-même reste un facturier micro.
Evoliz TPE en croissance, pré-compta Non — payant Oui — immatriculée en son nom Facturation sérieuse et pré-comptabilité : un vrai cran au-dessus du facturier micro. Générique : ni bibliothèque d’ouvrages, ni métrés, ni suivi d’affaires pour les métiers techniques.
Tolteck Artisans du bâtiment (micro et TPE) Non — payant À vérifier sur l’annuaire officiel Devis-factures pensé artisan : bibliothèques de prix bâtiment, prise en main très rapide. S’arrête au devis-facture : pas de suivi de chantier, d’achats, de stock ni de marge par affaire.
Obat Artisans et TPE du bâtiment Non — payant À vérifier sur l’annuaire officiel Devis, factures et situations de travaux orientés bâtiment, avec bibliothèques de prix. Couvre le documentaire du chantier, moins le pilotage complet (achats, stock, planning, rentabilité).
WHY Efficience L’étape au-dessus : AE techniques (bâtiment, atelier) qui structurent Non — logiciel professionnel, démonstrations illimitées Solution compatible — s’intègre aux plateformes agréées partenaires Devis techniques à variantes, bibliothèques d’ouvrages et de fournitures, suivi par affaire, marge réelle, éditeur français depuis 2004. Aucune à cet horizon : c’est précisément l’outil dans lequel on grandit — jusqu’à l’équipe de 10, 20, 50 personnes.
Aucune solution ne correspond à ces filtres.

Statuts et offres relevés le 22 août 2026 aux sources des éditeurs et de l’annuaire officiel. Le statut de plateforme agréée évolue vite : vérifiez la liste DGFiP avant de vous engager. Aucun lien de cette page n’est affilié.

Les signaux du plafond — quand l’outil micro ne suffit plus

Parlons franchement de notre place dans ce comparatif. WhySoft équipe d’abord des entreprises d’une dizaine de personnes et au-delà. Mais une part croissante de nos nouveaux clients sont des auto-entrepreneurs — presque toujours des profils techniques, et presque toujours pour les mêmes raisons.

Les signaux reviennent avec une régularité frappante : le devis technique qui prend des heures, faute de bibliothèque d’ouvrages et de fournitures — chaque chiffrage repart de zéro ; la marge réelle inconnue — on connaît son chiffre d’affaires, jamais ce que chaque chantier a réellement rapporté ; les fournitures suivies de tête — commandes, reliquats, dépôt ; les documents qui ne suivent plus — situations de travaux, acomptes, avoirs, retenue de garantie ; et la perspective d’embaucher, qui transforme chaque bricolage en dette. Aucun de ces manques n’est un défaut des outils micro : c’est la frontière de leur périmètre, exactement là où commence celui d’un logiciel de gestion.

L’étape au-dessus, sans re-déménager ensuiteWHY Efficience est le logiciel de devis-facturation-gestion de WhySoft : bibliothèques d’ouvrages et de fournitures, devis techniques à variantes, suivi par affaire, marge réelle, documents de chantier — édité en France depuis 2004, assistance à Landas. Ce n’est pas un facturier gratuit, et nous le disons sans détour : c’est l’outil dans lequel on grandit — de l’auto-entrepreneur technique à l’équipe de dix, vingt, cinquante personnes, sans changer de logiciel ni re-saisir dix ans de données. Découvrir WHY Efficience

Quel outil pour vous ? Deux questions suffisent

1. Votre activité ?
2. Où en êtes-vous ?

FAQ — les questions qu’on nous pose vraiment

Quel est le meilleur logiciel pour un auto-entrepreneur ?
Celui qui correspond à votre activité, pas au classement. Prestation de services simple : Abby, Indy ou Tiime couvrent tout, gratuitement. Compte pro et facturation ensemble : Qonto ou Shine. Artisan du bâtiment : un outil métier comme Tolteck ou Obat. Et si votre activité technique se structure — devis complexes, fournitures, marge par affaire — l’étape au-dessus s’appelle un vrai logiciel de gestion, comme WHY Efficience.
Existe-t-il un logiciel gratuit vraiment complet pour auto-entrepreneur ?
Oui, et c’est une spécificité française remarquable : Abby, Indy et Tiime proposent des socles gratuits durables incluant la facturation conforme — et ce sont des plateformes agréées immatriculées. Henrri et Facture.net sont gratuits pour la facturation pure. La frontière habituelle du gratuit : la déclaration URSSAF automatisée, la comptabilité complète ou les fonctions avancées passent au payant.
La facturation électronique concerne-t-elle les auto-entrepreneurs ?
Oui, intégralement. Depuis le 1er septembre 2026, tout auto-entrepreneur doit pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée ; l’obligation d’émettre s’appliquera aux micro-entreprises le 1er septembre 2027. Un PDF envoyé par mail ne sera plus une facture conforme en B2B. D’où la colonne « Plateforme agréée ? » du tableau : c’est devenu le premier critère de choix.
Un auto-entrepreneur du bâtiment a-t-il les mêmes besoins qu’un freelance ?
Non, et c’est le piège des comparatifs génériques. Le freelance facture du temps ; l’artisan chiffre des ouvrages : fournitures, main-d’œuvre, variantes, situations de travaux, retenue de garantie. Les facturiers micro gèrent très bien le premier cas et butent sur le second. C’est pour cela que le tableau distingue les profils — et que les outils métier bâtiment y figurent.
Quand faut-il passer à un logiciel plus complet que son outil micro ?
Quand vous ressentez les signaux du plafond : des devis techniques qui prennent des heures faute de bibliothèque, une marge réelle par chantier que vous ne connaissez pas, des fournitures suivies de tête, des documents qui ne suivent plus (situations, avoirs, acomptes). Chez WhySoft, notre cœur de cible est plutôt l’entreprise d’une dizaine de personnes et au-delà — mais beaucoup d’auto-entrepreneurs techniques nous rejoignent précisément à ce moment-là, parce qu’ils veulent un outil dans lequel grandir sans re-déménager leurs données.

Sources de cette page

  1. DGFiP / impots.gouv.fr — calendrier de la facturation électronique : obligation de réception au 1er septembre 2026 pour toutes les entreprises, obligation d’émission au 1er septembre 2027 pour les micro-entreprises et TPE ; sanctions prévues par la loi de finances 2026.
  2. Annuaire officiel des plateformes agréées (liste DGFiP) — statuts d’immatriculation consultés le 22 août 2026 ; voir notre annuaire interactif à jour.
  3. Sites et grilles tarifaires des éditeurs cités (Abby, Indy, Tiime, Henrri, Qonto, Shine, Evoliz, Tolteck, Obat…) — offres et périmètres relevés le 22 août 2026.
  4. ACOSS/URSSAF — plus de 2,4 millions de micro-entrepreneurs actifs (données 2026).
À retenirTrois réflexes avant de choisir
  1. 01Vérifiez le statut plateforme agréée avant tout : c’est le critère 2026, pas le prix.
  2. 02Choisissez selon votre métier : facturer du temps et chiffrer des ouvrages ne demandent pas le même outil.
  3. 03Reconnaissez les signaux du plafond : quand ils s’accumulent, changer d’échelle coûte moins cher que bricoler.
Auto-entrepreneur technique ? Venez avec vos devis.

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Arthur Gueroult

Côté relation client chez WhySoft Group, Arthur est expert des logiciels WHY et de Zeendoc. Il connaît les questions des utilisateurs avant même qu'ils ne les posent — ses articles y répondent sans détour.